Protein–RNA interactions for Protein: Q5JS54

PSMG4, Proteasome assembly chaperone 4, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMG4Q5JS54 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PSMG4Q5JS54 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PSMG4Q5JS54 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms