Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ARHGAP29Q52LW3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ARHGAP29Q52LW3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms