Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SYTL3Q4VX76 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms