Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBA0

KLHL40, Kelch-like protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL40Q2TBA0 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KLHL40Q2TBA0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KLHL40Q2TBA0 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms