Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

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Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC29.51■■■□□ 2.32
SPHKAPQ2M3C7 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPHKAPQ2M3C7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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