Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
IMPG1Q17R60 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
IMPG1Q17R60 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
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