Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUSP6Q16828 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUSP6Q16828 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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