Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTPROQ16827 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTPROQ16827 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
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