Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
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DDB1Q16531 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
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DDB1Q16531 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC26.7■■□□□ 1.87
DDB1Q16531 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DDB1Q16531 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
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