Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NEDD8Q15843 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NEDD8Q15843 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
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