Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CDSNQ15517 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CDSNQ15517 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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