Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SKIV2LQ15477 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SKIV2LQ15477 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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