Protein–RNA interactions for Protein: Q15388

TOMM20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20Q15388 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TOMM20Q15388 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
TOMM20Q15388 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms