Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDGFRLQ15198 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
PDGFRLQ15198 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
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