Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCAPD2Q15021 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
NCAPD2Q15021 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms