Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
GAPVD1Q14C86 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
GAPVD1Q14C86 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC33.68■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
GAPVD1Q14C86 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
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