Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PDE1CQ14123 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
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PDE1CQ14123 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
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PDE1CQ14123 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
PDE1CQ14123 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
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