Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPTAN1Q13813 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPTAN1Q13813 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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