Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TUBA3CQ13748 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
TUBA3CQ13748 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
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