Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTCH1Q13635 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTCH1Q13635 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms