Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TOP3AQ13472 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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TOP3AQ13472 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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TOP3AQ13472 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TOP3AQ13472 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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