Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
SF3B2Q13435 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SF3B2Q13435 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
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