Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRSQ13332 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
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PTPRSQ13332 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRSQ13332 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRSQ13332 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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PTPRSQ13332 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTPRSQ13332 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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