Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Length 919 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GRIK3Q13003 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GRIK3Q13003 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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