Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTPN13Q12923 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PTPN13Q12923 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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