Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KCNMA1Q12791 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KCNMA1Q12791 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms