Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SREBF2Q12772 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SREBF2Q12772 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
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