Protein–RNA interactions for Protein: Q12457

NSI1, RNA polymerase I termination factor, yeastyeast

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Length 570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSI1Q12457 snR79snR79 84 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 MTC3YGL226W 372 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 SMD1YGR074W 441 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 YIL058WYIL058W 285 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 UPS1YLR193C 528 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 PDC2YDR081C 2778 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 CWC22YGR278W 1734 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 VPS3YDR495C 3036 nt3.35□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 IOC3YFR013W 2364 nt3.34□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 YER039C-AYER039C-A 219 nt3.34□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 YPR146CYPR146C 330 nt3.34□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 snR46snR46 197 nt3.34□□□□□ -1.87
NSI1Q12457 GPI13YLL031C 3054 nt3.34□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 DOA4YDR069C 2781 nt3.34□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 CUL3YGR003W 2235 nt3.34□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 RPA135YPR010C 3612 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 SMC2YFR031C 3513 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 SSE1YPL106C 2082 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YBL053WYBL053W 375 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YBR224WYBR224W 516 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 DIS3YOL021C 3006 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 ORC2YBR060C 1863 nt3.33□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 MDV1YJL112W 2145 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 FAP7YDL166C 594 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 GOT1YMR292W 417 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 TIM12YBR091C 330 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 TCP1YDR212W 1680 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 VPS53YJL029C 2469 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 RSC1YGR056W 2787 nt3.32□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YGL217CYGL217C 342 nt3.31□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 RPL22AYLR061W 366 nt3.31□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YMR324CYMR324C 243 nt3.31□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 TRM7YBR061C 933 nt3.31□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 SOK1YDR006C 2706 nt3.3□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YIL166CYIL166C 1629 nt3.3□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YLR154W-EYLR154W-E 204 nt3.3□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 BIT61YJL058C 1632 nt3.3□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 PUF6YDR496C 1971 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 NMA111YNL123W 2994 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 NPC2YDL046W 522 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 snR191snR191 274 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 LRE1YCL051W 1752 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 IPT1YDR072C 1584 nt3.29□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YTA7YGR270W 4140 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 BRO1YPL084W 2535 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 NCL1YBL024W 2055 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YEL025CYEL025C 3567 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YIL059CYIL059C 366 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 INA22YIR024C 651 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 RRT15YLR162W-A 189 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 YNL028WYNL028W 318 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 CSE2YNR010W 450 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 TFB1YDR311W 1929 nt3.28□□□□□ -1.88
NSI1Q12457 CSR2YPR030W 3366 nt3.28□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 NOP4YPL043W 2058 nt3.28□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 HDA3YPR179C 1968 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YDL242WYDL242W 354 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 QCR7YDR529C 384 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YER189WYER189W 369 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 COX23YHR116W 456 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 MRPL33YMR286W 261 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 MSS11YMR164C 2277 nt3.27□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 TOF2YKR010C 2316 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 MIT1YEL007W 2001 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RBK1YCR036W 1002 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RPL20BYOR312C 519 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YOR329W-AYOR329W-A 210 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YGR250CYGR250C 2346 nt3.26□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YAK1YJL141C 2424 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 SKT5YBL061C 2091 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 TAF2YCR042C 4224 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YDR426CYDR426C 378 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RPS27BYHR021C 249 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 GIS2YNL255C 462 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YOR376WYOR376W 369 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YDR034C-DYDR034C-D 5313 nt3.25□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YDR193WYDR193W 399 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RPN1YHR027C 2982 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RPL38YLR325C 237 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YOR381W-AYOR381W-A 168 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 ENA5YDR038C 3276 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 ENA2YDR039C 3276 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 ENA1YDR040C 3276 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 AI2Q0055 2565 nt3.24□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 SPB1YCL054W 2526 nt3.23□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 APC11YDL008W 498 nt3.23□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 RPS21AYKR057W 264 nt3.23□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 APC9YLR102C 798 nt3.23□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 PKH1YDR490C 2301 nt3.22□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 ECM5YMR176W 4236 nt3.22□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 snR74snR74 88 nt3.22□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 SSS1YDR086C 243 nt3.22□□□□□ -1.89
NSI1Q12457 YGL069CYGL069C 465 nt3.22□□□□□ -1.89
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