Protein–RNA interactions for Protein: Q12276

HER1, HMG2-induced ER-remodeling protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HER1Q12276 FLO11YIR019C 4104 nt2.61□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YPL216WYPL216W 3309 nt2.6□□□□□ -1.99
HER1Q12276 HMF1YER057C 390 nt2.6□□□□□ -1.99
HER1Q12276 FPR1YNL135C 345 nt2.6□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YNL337WYNL337W 255 nt2.6□□□□□ -1.99
HER1Q12276 BCK1YJL095W 4437 nt2.6□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YMR31YFR049W 372 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 GPI14YJR013W 1212 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 TIM8YJR135W-A 264 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 RPS22BYLR367W 393 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 JLP2YMR132C 627 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 RPL9BYNL067W 576 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 IRC23YOR044W 474 nt2.59□□□□□ -1.99
HER1Q12276 YBP1YBR216C 2025 nt2.59□□□□□ -2
HER1Q12276 SMY2YBR172C 2223 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 ESC1YMR219W 4977 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 DNL4YOR005C 2835 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 YBL073WYBL073W 312 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 NFT1YKR103W 3657 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 SIP3YNL257C 3690 nt2.58□□□□□ -2
HER1Q12276 YHR078WYHR078W 1659 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 YKU80YMR106C 1890 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 SPB1YCL054W 2526 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 FCF2YLR051C 654 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 ISF1YMR081C 1017 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 BNR1YIL159W 4128 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 FAR11YNL127W 2862 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 COX1Q0045 1605 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 NOT5YPR072W 1683 nt2.57□□□□□ -2
HER1Q12276 BUB1YGR188C 3066 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 YDR239CYDR239C 2364 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 NPR1YNL183C 2373 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 YFL063WYFL063W 456 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 PRE4YFR050C 801 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 tM(CAU)Q1tM(CAU)Q1 76 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 RPS29AYLR388W 171 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 YPL229WYPL229W 621 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 SSY1YDR160W 2559 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 IKI3YLR384C 4050 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 FUS1YCL027W 1539 nt2.56□□□□□ -2
HER1Q12276 MRD1YPR112C 2664 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 NUM1YDR150W 8247 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 AMS1YGL156W 3252 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 SDC25YLL016W 3147 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 ACM1YPL267W 630 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 YOP1YPR028W 543 nt2.55□□□□□ -2
HER1Q12276 ORC2YBR060C 1863 nt2.54□□□□□ -2
HER1Q12276 TPS2YDR074W 2691 nt2.54□□□□□ -2
HER1Q12276 KEL2YGR238C 2649 nt2.54□□□□□ -2
HER1Q12276 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.54□□□□□ -2
HER1Q12276 YNL034WYNL034W 1839 nt2.54□□□□□ -2
HER1Q12276 LEU3YLR451W 2661 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 YJL015CYJL015C 285 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 NCE101YJL205C 162 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 RPL26AYLR344W 384 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 YMR194C-AYMR194C-A 225 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 COX7YMR256C 183 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 ESF2YNR054C 951 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 PCF11YDR228C 1881 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 ORC1YML065W 2745 nt2.53□□□□□ -2
HER1Q12276 PUF4YGL014W 2667 nt2.53□□□□□ -2.01
HER1Q12276 TOR1YJR066W 7413 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 SEC26YDR238C 2922 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 COG3YER157W 2406 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 NAB3YPL190C 2409 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 KRE33YNL132W 3171 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 snR76snR76 109 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 RPS17BYDR447C 411 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YER079C-AYER079C-A 339 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 ERP6YGL002W 651 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YGR050CYGR050C 357 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YIL058WYIL058W 285 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 PSY1YKL076C 384 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 CRS5YOR031W 210 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 ECM5YMR176W 4236 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YJL016WYJL016W 1686 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 GIN4YDR507C 3429 nt2.52□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YER138CYER138C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YER160CYER160C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YJR027WYJR027W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YML039WYML039W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YML045WYML045W 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YMR050CYMR050C 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.51□□□□□ -2.01
HER1Q12276 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.51□□□□□ -2.01
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