Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CD300CQ08708 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD300CQ08708 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms