Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FMODQ06828 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FMODQ06828 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FMODQ06828 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FMODQ06828 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FMODQ06828 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FMODQ06828 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
FMODQ06828 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms