Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBE3AQ05086 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
UBE3AQ05086 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms