Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SSBP1Q04837 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SSBP1Q04837 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms