Protein–RNA interactions for Protein: Q04749

AVO2, Target of rapamycin complex 2 subunit AVO2, yeastyeast

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
AVO2Q04749 RPB11YOL005C 363 nt0.94□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YNL284C-BYNL284C-B 5268 nt0.94□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 DAS1YJL149W 1992 nt0.94□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 APL1YJR005W 2103 nt0.94□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 MSH3YCR092C 3057 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 BUD26YDR241W 288 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 CAJ1YER048C 1176 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SEC28YIL076W 891 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YJL015CYJL015C 285 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 PGA1YNL158W 597 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SUS1YBR111W-A 291 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 HIR3YJR140C 4947 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YGR250CYGR250C 2346 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 MNL2YLR057W 2550 nt0.93□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 MUD2YKL074C 1584 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SRB7YDR308C 423 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 BNA7YDR428C 786 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 LCL2YLR104W 396 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YNL179CYNL179C 438 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 NCA2YPR155C 1851 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SCC2YDR180W 4482 nt0.92□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SPE1YKL184W 1401 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 MLH3YPL164C 2148 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 RAD6YGL058W 519 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YAL064WYAL064W 285 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 ATP18YML081C-A 180 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 MGE1YOR232W 687 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SNC2YOR327C 348 nt0.91□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 SPT7YBR081C 3999 nt0.9□□□□□ -2.26
AVO2Q04749 YCR016WYCR016W 873 nt0.9□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YLR307C-AYLR307C-A 264 nt0.9□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YOR105WYOR105W 327 nt0.9□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 BUD3YCL014W 4911 nt0.9□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 DAD1YDR016C 285 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 TMA20YER007C-A 546 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RPL29YFR032C-A 180 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 BET4YJL031C 984 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 POL32YJR043C 1053 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 FCF2YLR051C 654 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 TIF11YMR260C 462 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EST2YLR318W 2655 nt0.89□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YER088C-AYER088C-A 324 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YLR031WYLR031W 561 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RIO2YNL207W 1278 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 PET123YOR158W 957 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 TFB6YOR352W 1032 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 GPX2YBR244W 489 nt0.88□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 MSN5YDR335W 3675 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 DOP1YDR141C 5097 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 TRM732YMR259C 4263 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 VPS74YDR372C 1038 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YDR537CYDR537C 606 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 VOA1YGR106C 798 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YHL037CYHL037C 402 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RPC25YKL144C 639 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YNL114CYNL114C 372 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 PHO80YOL001W 882 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YBR287WYBR287W 1284 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 SPO75YLL005C 2607 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 MDS3YGL197W 4464 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 DOT6YER088C 2013 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RLM1YPL089C 2031 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt0.87□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 NCS2YNL119W 1482 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 NST1YNL091W 3723 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 MSC6YOR354C 2079 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 HTB1YDR224C 396 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RSM28YDR494W 1086 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YHR052W-AYHR052W-A 195 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YHR054W-AYHR054W-A 195 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YIR020C-BYIR020C-B 735 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YJL119CYJL119C 324 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YLR302CYLR302C 363 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 MSS11YMR164C 2277 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 15S_rRNA15S_rRNA 1649 nt0.86□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 NOT5YPR072W 1683 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 ALK1YGL021W 2283 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YCR043CYCR043C 384 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 GEP7YGL057C 864 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 LAG1YHL003C 1236 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 RRT15YLR162W-A 189 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 GPN3YLR243W 819 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YNL226WYNL226W 411 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YOR152CYOR152C 771 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 SPR2YOR214C 711 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 ROX1YPR065W 1107 nt0.85□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YLR149CYLR149C 2193 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 MTC7YEL033W 420 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 LOC1YFR001W 615 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 YGL042CYGL042C 306 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EMT1tM(CAU)D 73 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EMT5tM(CAU)J1 73 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EMT3tM(CAU)J2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EMT4tM(CAU)M 73 nt0.84□□□□□ -2.27
AVO2Q04749 EMT2tM(CAU)O2 73 nt0.84□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 30.4 ms