Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YHR130CYHR130C 336 nt2.35□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt2.35□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 GPI15YNL038W 690 nt2.35□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 MPH1YIR002C 2982 nt2.35□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 UTP13YLR222C 2454 nt2.34□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YLR379WYLR379W 375 nt2.34□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 PBI2YNL015W 228 nt2.34□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 ATP19YOL077W-A 207 nt2.34□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt2.34□□□□□ -2.03
SYF1Q04048 IST2YBR086C 2841 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 CDC50YCR094W 1176 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YGR045CYGR045C 363 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YAP3YHL009C 993 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YKL165C-AYKL165C-A 234 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 FYV7YLR068W 456 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 NOP15YNL110C 663 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 VMA9YCL005W-A 222 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YOL098CYOL098C 3114 nt2.33□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RTT107YHR154W 3213 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YJL127C-BYJL127C-B 159 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 IRC8YJL051W 2469 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 NIC96YFR002W 2520 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 IPT1YDR072C 1584 nt2.32□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 SMB1YER029C 591 nt2.31□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 MRPL44YMR225C 297 nt2.31□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YNL010WYNL010W 726 nt2.31□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 DGR1YNL130C-A 147 nt2.31□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 NOP14YDL148C 2433 nt2.31□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RVS161YCR009C 798 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 MZM1YDR493W 372 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 NOP10YHR072W-A 177 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YHR180W-AYHR180W-A 183 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RPS7BYNL096C 573 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 SPC29YPL124W 762 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YPL197CYPL197C 414 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 IRA2YOL081W 9240 nt2.3□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 DIS3YOL021C 3006 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 VPH1YOR270C 2523 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YJL016WYJL016W 1686 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YCR001WYCR001W 315 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YDL068WYDL068W 330 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 SMD1YGR074W 441 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 BIG1YHR101C 1008 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 SNC1YAL030W 354 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 TIM8YJR135W-A 264 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 GRX8YLR364W 330 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YOR333CYOR333C 417 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 ROX1YPR065W 1107 nt2.29□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 MCD1YDL003W 1701 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 BNA7YDR428C 786 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YGL024WYGL024W 336 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RPF1YHR088W 888 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RPI1YIL119C 1224 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RMP1YLR145W 606 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 CTK3YML112W 891 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 PKR1YMR123W 369 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 DDR48YMR173W 1293 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 RTT101YJL047C 2529 nt2.28□□□□□ -2.04
SYF1Q04048 ELG1YOR144C 2376 nt2.28□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 RUD3YOR216C 1455 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 TRL1YJL087C 2484 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 RPL27BYDR471W 411 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 COX13YGL191W 390 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 VOA1YGR106C 798 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 RPB5YBR154C 648 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 BFA1YJR053W 1725 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 NUP120YKL057C 3114 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SEC31YDL195W 3822 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 MNE1YOR350C 1992 nt2.27□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SPC72YAL047C 1869 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SFB2YNL049C 2631 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 NUP82YJL061W 2142 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YPS5YGL259W 498 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YJL007CYJL007C 315 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YJR140W-AYJR140W-A 150 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 ATP15YPL271W 189 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 IRC16YPR038W 360 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 CRM1YGR218W 3255 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 HSH155YMR288W 2916 nt2.26□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 GRR1YJR090C 3456 nt2.25□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YDR286CYDR286C 345 nt2.25□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YLR171WYLR171W 390 nt2.25□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YPL205CYPL205C 345 nt2.25□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 RGA1YOR127W 3024 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 MYO4YAL029C 4416 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YEL030C-AYEL030C-A 315 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YKL111CYKL111C 336 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YLR031WYLR031W 561 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SPO22YIL073C 2928 nt2.24□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 ASM4YDL088C 1587 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SOK2YMR016C 2358 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 BI2Q0110 1272 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 VPS8YAL002W 3825 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 NCE101YJL205C 162 nt2.23□□□□□ -2.05
SYF1Q04048 SYM1YLR251W 594 nt2.23□□□□□ -2.05
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