Protein–RNA interactions for Protein: Q04007

SND1, SRP-independent targeting protein 1, yeastyeast

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Length 877 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SND1Q04007 YML039WYML039W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YML045WYML045W 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YMR050CYMR050C 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YKU80YMR106C 1890 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 TWF1YGR080W 999 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 LSM7YNL147W 348 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 GIN4YDR507C 3429 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 SRB8YCR081W 4284 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 NIC96YFR002W 2520 nt2.77□□□□□ -1.97
SND1Q04007 VPS52YDR484W 1926 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 AXL1YPR122W 3627 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YIL174WYIL174W 228 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YJL222W-AYJL222W-A 228 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 CDC33YOL139C 642 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 ATP3YBR039W 936 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YPR197CYPR197C 564 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 RRP6YOR001W 2202 nt2.76□□□□□ -1.97
SND1Q04007 RPO41YFL036W 4056 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 IPT1YDR072C 1584 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 EDS1YBR033W 2760 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 MSL1YIR009W 336 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 HIT1YJR055W 495 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YML099W-AYML099W-A 330 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 ORC2YBR060C 1863 nt2.75□□□□□ -1.97
SND1Q04007 FLO11YIR019C 4104 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 MSS11YMR164C 2277 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YDL041WYDL041W 354 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 PNC1YGL037C 651 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 RPS20YHL015W 366 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YLR031WYLR031W 561 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 GRX8YLR364W 330 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 SEC26YDR238C 2922 nt2.74□□□□□ -1.97
SND1Q04007 SOK2YMR016C 2358 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YPP1YGR198W 2454 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YDR209CYDR209C 414 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 ACM1YPL267W 630 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 IRC10YOL015W 1761 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 NUP120YKL057C 3114 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 TAE2YPL009C 3117 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 INP52YNL106C 3552 nt2.73□□□□□ -1.97
SND1Q04007 RPL14BYHL001W 417 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 ERP4YOR016C 624 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YOR199WYOR199W 330 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 YSY6YBR162W-A 198 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 OSW7YFR039C 1533 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 SIR3YLR442C 2937 nt2.72□□□□□ -1.97
SND1Q04007 SGM1YJR134C 2124 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 FKS3YMR306W 5358 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 ESL2YKR096W 3588 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 RTT102YGR275W 474 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YKL066WYKL066W 444 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 COX7YMR256C 183 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 ZEO1YOL109W 342 nt2.71□□□□□ -1.98
SND1Q04007 AFI1YOR129C 2682 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 RTT10YPL183C 3042 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 KEL2YGR238C 2649 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 CDC50YCR094W 1176 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YER076W-AYER076W-A 348 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 PET191YJR034W 327 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 RPS18BYML026C 441 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YMR320WYMR320W 306 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YOR050CYOR050C 348 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SNX41YDR425W 1878 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 REV3YPL167C 4515 nt2.7□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SPC72YAL047C 1869 nt2.69□□□□□ -1.98
SND1Q04007 RRP12YPL012W 3687 nt2.69□□□□□ -1.98
SND1Q04007 CDC53YDL132W 2448 nt2.69□□□□□ -1.98
SND1Q04007 snR70snR70 164 nt2.69□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SIR4YDR227W 4077 nt2.69□□□□□ -1.98
SND1Q04007 PTP3YER075C 2787 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 CRM1YGR218W 3255 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 ESC1YMR219W 4977 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YEL057CYEL057C 702 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SMD1YGR074W 441 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 RPL40BYKR094C 387 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 BSC3YLR465C 309 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 NAB6YML117W 3405 nt2.68□□□□□ -1.98
SND1Q04007 BUB1YGR188C 3066 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 snR79snR79 84 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YER121WYER121W 345 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 NOP10YHR072W-A 177 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YPL225WYPL225W 441 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 COX1Q0045 1605 nt2.67□□□□□ -1.98
SND1Q04007 YMR324CYMR324C 243 nt2.66□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SNC2YOR327C 348 nt2.66□□□□□ -1.98
SND1Q04007 PDR3YBL005W 2931 nt2.66□□□□□ -1.98
SND1Q04007 SGD1YLR336C 2700 nt2.66□□□□□ -1.98
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