Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SP4Q02446 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SP4Q02446 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP4Q02446 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP4Q02446 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SP4Q02446 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
SP4Q02446 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SP4Q02446 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms