Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TNFRSF17Q02223 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TNFRSF17Q02223 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms