Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HSF1Q00613 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms