Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
FANCCQ00597 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms