Protein–RNA interactions for Protein: P62913

RPL11, 60S ribosomal protein L11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL11P62913 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RPL11P62913 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL11P62913 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
RPL11P62913 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RPL11P62913 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms