Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HERVK_113P62684 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms