Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
ERVS71-1P61550 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
ERVS71-1P61550 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms