Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
TMEM258P61165 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TMEM258P61165 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TMEM258P61165 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
TMEM258P61165 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
TMEM258P61165 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms