Protein–RNA interactions for Protein: P60520

GABARAPL2, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL2P60520 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL2P60520 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms