Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00313P59037 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00313P59037 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms