Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CABP4P57796 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CABP4P57796 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CABP4P57796 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CABP4P57796 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CABP4P57796 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CABP4P57796 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CABP4P57796 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CABP4P57796 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms