Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GSDMDP57764 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GSDMDP57764 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms