Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBASH3AP57075 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBASH3AP57075 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms