Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
AFDNP55196 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
AFDNP55196 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
AFDNP55196 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
AFDNP55196 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
AFDNP55196 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms